ディスク容量に空きがないとサーバが騒ぐのでちょっと見てみたら、C:\Documents and Settings\UserName\Local Settings\Temp\*にPrf*.tmpにというファイルがいくつか作成されており、うち2つが13GBを超えていました。
※*は任意の数字
このファイルがなにをするものかいまいち分からないのですが、ここを見る感じではプロファイルの同期を行うための一時ファイルのようです。ユーザが消すことはできないファイルのようです。
結果としてはリモートデスクトップでログインしっぱなしになっていた接続上のプログラム（SQL Server Profilerとか）を終了して、ログアウトしてみたら、該当のファイルはなくなっていました。