ネットワーク設定でパブリックアクセスを無効にしたAzure Data Lake Storage Gen2なストレージアカウントに対してプライベートリンクで接続する場合は、dfsサブリソースへのプライベートリンクだけでなくblobサブリソースにもプライベートリンクを作る必要があります。
SynapseワークスペースからADLS Gen2に接続する場合はdfsサブリソースへのプライベートリンクだけでもADLS Gen2上のコンテンツを見ることができるのですが、それだけだとAzure Storage ExplorerやAzureポータルから参照することができません。
その場合、Blobへのプライベートリンクを追加すると見えるようになります。
Microsoftの情報
こちらのページの下記部分がそれを解説しているところと思われます。