SharePointで、権限設定機能を使おうとするとたいていは使えるのだけれども何かのきっかけで403エラーになる、または、いつも403だけどなぜかちゃんと使える場合があるというケースが発生していましたが、John W Powellさんのエントリーの対応方法で解決しました。
簡単に言うと、SharePointサーバーの仮想ディレクトリにあるbinフォルダに server\users のリード・実行権限をつけましょう、という内容です。
私のところではTeam Foundation Serverのプロジェクトポータルを使っている時にこの問題が発生したのですが、この解決方法で問題解消したようです(経過観察中…)。